Thành lập năm 1923, là một trong những cơ sở nghiên cứu khoa học vể biển ra đời sớm nhất ở Việt Nam và được coi là cơ sở lưu trữ hiện vật và nghiên cứu về biển lớn nhất Đông Nam Á. Viện nằm trên một khu đất rộng rãi, ngay cảng Cầu Đá, cách trung tâm thành phố Nha Trang 06 km.

Nơi đây có trên 20.000 mẫu vật của hơn 4.000 loài sinh vật biển và nước ngọt đã được gìn giữ, sưu tầm từ nhiều năm, bên cạnh những mẫu vật sống được nuôi thả trong bể kính. Ở đây còn có bộ xương cá voi lưng gù dài 18 m, nặng 18 tấn…